面积占东京都西部1/3、人口超过230万、八成以上由学生组成的学园都市，尖端科技发展迅速，超能力开发已经深入到城市的各个角落。超能力水平高达Level5的御坂美琴（佐藤利奈配音）如往常一样和初春饰利（丰崎爱生配音）、白井黑子（新井里美配音）等好友过着平凡的日子，间或热血爆发挫败各种扰乱城市的阴谋。某天，在调查一起现今卡事件时她邂逅了长点上机学园的布束砥信（叶山郁美配音），从而得知用美琴的DNA大批量复制超能力者的“量产型能力者计划”。不安定的气氛在都市角落肆意蔓延……本片为镰池和马（原作）、冬川基（作画）的原作《魔法禁书目录》的外传漫画第二季TV动画。

《某科学的超电磁炮S》（A Certain Scientific Railgun S）是一部日本动画，是《某科学的超电磁炮》系列的第二季，根据镰池和马场原作的同名漫画改编而成。该系列由J.C.STAFF制作，并于2013年4月至9月在日本播出。

故事背景设定在一个科技高度发达的城市——学园都市。这座城市是一个拥有现代科技和超能力者的世界，在这里，人们普遍都具备一种被称为"能力"的超能力。故事主要围绕着主人公御坂美琴展开，她是一个拥有电磁能力的高中生，也是该系列的核心角色之一。

在《某科学的超电磁炮S》中，故事主要聚焦于学园都市的暗部组织"TREE Diagram"的阴谋以及御坂美琴的冒险。御坂美琴和她的朋友们，包括同样拥有超能力的上条当麻，将揭示这个组织的真实面目，并为保护自己和城市的安全而战斗。

该季的故事线主要分为两个重要的情节：第一个情节是"委员长篇"，其中御坂美琴和她的好友佐天泪子参与了一项城市级别的研究项目，但却发现了一些不对劲的事情；第二个情节是"三方决战篇"，当麻、美琴和一些其他角色卷入了一个涉及"TREE Diagram"、科学和魔法的巨大阴谋中，他们为了揭露真相并保护自己的朋友们而进行了一场决战。

《某科学的超电磁炮S》在剧情中融入了科学、超能力、阴谋和战斗等元素，展现了学园都市这个特殊世界的复杂性。同时，它也探讨了人性、友情和正义的主题，通过角色之间的关系和成长来呈现这些主题。

这部动画作品以其扣人心弦的剧情、精美的动画制作和丰富的角色塑造而备受观众喜爱，成为《某科学的超电磁炮》系列的重要一环。